国取代国民党政权在联合国的中国席位，中国在西藏的军事行动势必损害这种努力。当然，这份照会无法阻止中国人民解放军进入西藏。紧接着，新德里就提出一项措词激烈的抗议，对西藏遭到“入侵”以及中国使用武力解决它和西藏的关系问题表示遗憾。

    新中国的答复也同样尖锐：“西藏是中国领土不可分割的一部分，西藏问题完全是中国的一个内政问题，中国人民解放军必须进入西藏，解放西藏人民，并保卫中国边疆。”

    面对着新中国1950年恢复了在西藏的权力的既成事实，印度政府的反应是实用主义的。他们一方面继续执行对中国的友好政策，承认过去西藏与中央在法律上的密切关系；另一方面却下令把印度的行政管辖范围扩展到整个东北边境特区，这就是那块位于“麦克马洪线”南面的部落地带的名称。更有甚者，印度当时还决定：如果中国一旦提出这个问题，印度将拒绝谈判。

    在印度政府公开官布“麦克马洪线”是印度的东北边界的头几年，中国政府为了顾全大局，没有提出抗议。然而，这种忍让被印度当局误认为中国默许他们的做法，于是得寸进尺，把这项政策扩大到边界的其他各段。

    1954年，印度官方地图在东段用实线代替虚线注明“麦克马洪线”为国际边界。印度政府同时还决定，只要有可能，就应该把边境哨所推进到有争议的地方。因此，在中印边境中段和东段，印军的哨所都向前推进了。

    印度在中段向前推进，立即引起中国的不满。1954年7月，中国政府照会印度政府，抗议印度军队侵入中国领土，认为印方的这一行动不符合中印两国互不侵犯、友好相处的原则，而这些原则是刚刚写成条文载入“潘查希拉”协定中的。印度政府却答复说该处领土属于印度，并反过来要中国尊重五项原则，将其人员撤出。

    1959年夏季，西藏发生叛乱。印度政府公开支持西藏叛乱分子，引起中印两国邦交的恶化。双方沿着中印边界调兵遣将，使得两国走向迎面对撞的局面。

    在中印边境东段，康巴族叛乱分子在雅鲁藏布江和“麦克马洪线”之间进行集结，使得中国政府也在这个地区派驻重兵，把军队开到边界上，防止叛乱分子越境进入印度寻求庇护。而在边界的另一面，印度军队却把他们的前沿哨所准进到“麦克马洪线”，在有些地方甚至越过了“麦克巧洪线”。

    1959年8月25日，中印边界争端第一次在“麦克马洪线”上演变为真枪实弹的射击，双方互有伤亡。