城完全的暴露在燕军的眼下。

    浦口之战失败后，建文帝决定让掌管长江水师的都督佥事陈瑄赶紧去援助盛庸，建文帝认为长江天堑与燕军对抗，燕军不会赢得太轻松，可是没想到的是陈瑄并未执行建文帝命令，而是跑到了燕军那里，投降了朱棣。这个时候，朱允炆已经孤立无援了，建文四年六月十三日，朱棣发起了总攻，镇守金川门的谷王朱橞和李景隆利用职务之便，打开城门，放燕军进了南京。。

    自此南京已经可以说是不在朱允炆的手中了。

    京师遂破，燕军进了南京城，朱允炆的部下奋力抵抗，在一场场混战中，南京城突然起火了，在火势扑灭之后发现了几具烧焦了的残骸，无法辨认，同时也找不到朱允炆的踪影，朱棣在这几具尸体前看了很久很久，不曾说一句话，据太监说它们是皇帝、皇后和他的长子朱文奎的尸体，即使朱棣不相信却也没有办法，而现在的问题不是这几具无法辨认的残骸里有没有朱允炆了，而是最重要的皇位问题该如何处理。