此时，正好黄巢派的使者来到凤翔劝降，凤翔的监军彭敬柔恭敬对待使者，并摆宴席接待，表示愿意归降。

    在宴席吃饭的时候，诸将都哭泣，使者感到非常奇怪。幕僚孙储解释说：“郑相公因风痹不能前来，我们都很悲伤。”但实际是郑畋和很多属下将官不愿意接受黄巢的招抚。

    郑畋醒来后来得知这一状况，认为人心尚未讨厌唐朝，就召集将官深明大义，终于得到诸将的支持。此后，当黄巢再派使者来劝降，郑畋毫不犹豫杀死使者。

    郑畋在凤翔积极加固城壕，打造器械，训练军士，约请临近的各道官军合兵讨伐农民军，得到了肯定的答复。郑畋于是派儿子去向唐僖宗报告这些情况。

    唐僖宗到达兴元（汉中市）时，迫不及待的向天下诸道颁发诏书，命令各道调发全军收复京城长安，任命郑畋为京城四面诸军行营都统。

    河北的义武军节度使王处存，冶所在河北定州市，他得知长安被攻陷时，哭了好几天。不等皇上下诏，他就派遣二千人从小道前往汉中，保护皇上，如此忠心实在少见。

    当时，还有数万朝廷的禁军分守关中各地，郑畋派人把他们都召集到凤翔来，官军的势头又逐渐旺盛了。

    而在长安，由于唐金吾大将军张直方主动迎接黄巢进城，因而受到黄巢的信任，那些不愿意投降农民军的官员藏在他家中的夹墙内。但张直方还与身在凤翔的郑畋暗通消息，没有不透风的墙，消息泄露后，张直方被农民军处死，藏身在他家的一批官吏也被杀死。

    农民军对官员的杀戮是空前的，前宰相豆卢瑑、崔沆，左仆射于琮、右仆射刘邺，太子少师裴谂、御史中丞赵濛、刑部侍郎李溥、京兆尹李汤扈都来不及逃走，藏匿在民间，结果被搜查出来后都被处死。农民军还挖了前宰相卢携的坟墓泄愤。这也造成了官军与农民军的对立，有时是水火不容，对农民军是不利的。

    为了应对郑畋组织的官兵反扑，黄巢也不敢大意轻敌，他派遣使者到河中，向河中留后王重荣索要军粮，由于要的次数比较多，使者前后达数百人。

    河中的官民无法负担，纷纷叫苦。王重荣就对部下说：“起初我背叛朝廷归顺草贼，是为了使河中免于灾难，如今黄巢又调粮食又要军士，我们总有一天难以承受，不如再起兵抗拒黄巢。”大家都表示赞同，王重荣就下令把黄巢派来的使者全部处死。

    得知河中的王重荣又回归朝廷，黄巢大怒，派兵征讨。命令大将朱温从同州发兵，黄巢的