系较多，虽然成立了统一领导中心，但统一指挥仍很困难。一个地区可能会有几派游击队同时活动，他们之间独立行动多，相互联系少，在作战指挥上基本上是独立自主，各自为战。

    任何对他国实行的军事占领都将必然会遇到对方民间武装长期袭扰的挑战。苏军在阿富汗也不例外。面对阿游击队的多点袭击，苏军以师为单位，将阿划分为7 个区，分别负责所在地区的反游击战任务。这样就从组织上建立了在统一作战下实施分割指挥的反游击战体制。在作战方式上先后提出了固点、守线、净化边境和重点扫荡等多种样式。苏军在加强城市守备的同时，把重心放到城市外围，摧毁距市区20公里内的村庄，毁坏路旁丛林，并大搞清乡。在交通线上，为了对付游击队的破坏，采取控制公路重要路段和桥梁，在行军纵队或运输车队经过时，派出地面部队和空中警戒分队护送。另外，苏军还使用机动部队对阿游击区和根据地实行围剿。这种围剿一般实施地面和空中联合进攻，对关键地区反复扫荡。

    为了实现长期占领的目的，苏军还封锁边境，重点控制能够通往国外的各个山口和要道，以期切断阿游击队的外援和国外训练基地。除了军事打击之外，苏联还通过多种方式进行政治宣传，设法消除社会上对抵抗组织的支持。

    苏军的反游击战措施收到一定的效果。但苏军已陷入了阿富汗" 泥潭" 中不能自拔，由此产生的许多派生问题单靠军事占领是无济于事的。国际社会的反响日益强烈，联大和一些国际会议均通过了一系列要求苏联撤军的决议。苏联面对速胜无望、消耗太大、士气低落和国际社会的同声反对，终于在1988年4 月15日签署了关于政治解决阿富汗问题的日内瓦协议，于同年5 月15日开始从阿富汗撤军。至1989年2 月15日，苏军全部撤出了阿富汗。

    持续9 年的苏阿战争终告结束。